Déclarée en sous-préfecture d'Avesne-sur-Helpe le 16 septembre 1996, la Compagnie Thomas Duchatelet est une association 1901 qui a pour objectif principal la création et la diffusion d'œuvres chorégraphiques.

En 2000, puis en 2001, deux emploi-jeunes sont successivement créés afin d'accompagner au mieux les activités de la compagnie tandis qu'un local administratif est mis à disposition par l'agence d'architecture Caucheteux & Bello à Villeneuve d'Ascq (59).
En 2007, la Compagnie Thomas Duchatelet  emménage dans un des Labos de la Condition Publique à Roubaix. A cette occasion des contrats aidés ont été mis en place dans le cadre du projet Federdanse.

Depuis ses débuts, les partenaires institutionnels sont attentifs aux projets développés par le chorégraphe. La compagnie est subventionnée par  le Conseil Régional Nord Pas-de-Calais, le Département du Nord. A partir de l'année 2001, le Département du Pas-de-Calais aide la compagnie. Au niveau local, la Ville de Lille apporte son soutien à la compagnie depuis l'an 2002.

La compagnie devient compagnie associée en résidence à la Maison de l'Art et de la Communication de Sallaumines de 2008 à 2010.

Au fur et à mesure de son évolution, la compagnie tisse également des liens durables avec les principaux acteurs de la vie culturelle dans la région Nord Pas-de-Calais.